位于北欧的美国海军基地
前往摧毁全球解放军的火箭的美国北欧海军基地的部队到达了拜科努尔。当全球解放军向欧洲发射第一枚炭疽导弹的时候，给予了世界震惊。不同于第一次袭击，这次全球解放军的高层决定攻击军事目标。一个位于北部欧洲的美国海军基地在没有任何警告的情况下受到了攻击，大多数基地人员被害，还有一些重伤。在拜科努尔的美军得知这个消息后，带着满腔怒火发起了对全球解放军的进攻。他们占领了直接开往火箭基地的火车站并且拦截了一列向发射架运送另一枚火箭的火车。在发射架附近驻守的全球解放军部队吃惊的看到帕拉丁坦克与悍马出现在运输的火车上。呼叫而来的A-10空袭并摧毁了毒刺导弹阵地，美国空军决定一定要确保这里发射设备永远无法再构成威胁。由B3轰炸机投下了大型空爆炸弹（MOAB）落在了这里的发射设施。最终巨大的爆炸摧毁了彻底摧毁了发射基地并且取保了美国的胜利。
导弹落在美国基地上。
美国基地遭到了导弹的袭击。在拜科努尔的胜利的同时也付出了高昂的代价。这次被导弹袭击的海军基地使得美国在欧洲的力量遭到削弱。幸运的是，包括了CVN-88“代达罗斯”号航空母舰和“无畏”级战列舰群的舰队在基地受到袭击时已经离开了那里，并未受到损失。由于惧怕会出现对舰队进行另一次袭击，海军指挥官决定让舰队立即出海。非常走运，舰队正好需要起航去索马里执行一个紧急任务。索马里看似是一个远离与全球解放军争斗的地方，但最近美国到这个城市的救援船都被由全球解放军支持的当地军阀截取了。“代达罗斯”号立刻起飞战斗机攻击城市中的军阀并且伯顿上校和他的部队防守港口防范全球解放军的反击。急救物资在保护下成功运达了城市的中心仓库。然后舰队发现了当地军阀的基地，对其实施了猛烈的炮击和空袭。在执行搜索行动期间伯顿上校发现了一些关于斯拉克斯博士的文件，有关他的化学武器计划和资金来源。
在俄罗斯厄尔布鲁士山的一侧，一架B3轰炸机为伯顿上校和特种小分队在研究所附近的降落扫清了场地。在河流的另一侧的化合设备那里，黑莲花侵入了设备的电脑并获得了资料。伯顿和莲花赶赴山腰的设备处，沿着这条路上山，黑莲花占领了一座全球解放军基地同时伯顿上校也救出了美国战俘。在黑莲花从研究所电脑取得资料后，伯顿上校引爆在山腰上的C4炸药造成的雪崩摧毁了实验室。
埃米斯巴德油田
在埃米斯巴德油田发现了有关斯拉克斯博士化学武器计划的证据，美国将其提交了联合国。斯拉克斯博士已经被国际战犯法庭指控，美国也被授权阻止他的行动。依仗着充足的国际支持美军开往了伊朗对埃米斯巴德油田展开进攻。阻止在没有联合国授权的情况下斯拉克斯博士利用油田提供的资金进行他的研究。美国也惧怕最近在伊朗的行动找来过多的政治问题。夜空中闪烁着全球解放军高射炮火的闪光和射向美国运输机的导弹。伞兵降落在埃米斯巴德机场并且迅速控制了这里。后面的几个小时后美军需要迎接一个最艰难的考验，他们需要被迫解除掉安装在油井上的炸弹，全球解放军从当地的村庄发起了进攻与自杀攻击。伯顿上校和他的狙击手小队解决掉了煽动自杀袭击的当地电视台，同时中央情报局间谍和帕拉丁坦克控制了油田的局面。这里的全球解放军部队准备使用飞毛腿导弹风暴抵挡美军的推进，在全球解放军炮击和导弹如雨点般的攻击下，美国坦克缓慢的继续推进并且到山坡并最终压制了全球解放军的基地，当黎明来临时埃米斯巴德油田已经完全在美军控制下了。
对斯拉克斯博士场地的导弹袭击。
在他的资金来源被切断后，美军的继续前进使得斯拉克斯博士被迫实施他的最终计划。通过他大规模的化学提炼斯拉克斯博士已经将4个弹头填充满了他的炭疽贝塔毒素准备直接攻击美国本土。美军已经没有退路，准备好了对斯拉克斯博士设备的大规模攻击。通过间谍卫星和间谍无人机的的定位，美军发射了大量的巡航导弹直指斯拉克斯博士生产设备的心脏地带。导弹成功的摧毁了设施并且打响了攻打斯拉克斯博士基地的信号。美军士兵们已经配发了化学防护服并且以最高的警戒性穿过城区。通过那些联络惧怕斯拉克斯博士的研究将会杀死所有人的全球解放军分裂分子，美国与他们联合起来对抗斯拉克斯博士的部队，斯拉克斯博士命令他的部队通过偷袭和伪装延缓美军的推进。他的部队完全用各种化学毒素武器武装恐吓着袭来的敌人。美国动用了鬼怪式炮艇机，大型空爆炸弹和A-10空袭来清除这些顽强的抵抗者。配备了复仇者和微波坦克的十字军坦克营增援了对斯拉克斯博士基地的进攻，全球解放军分裂分子也提供了他们自己使用的毒素武器装备。最终粒子炮切开了斯拉克斯博士基地的心脏地带，美军击败了那些疲倦的防卫者。斯拉克斯试图提早发射那些导弹，但游骑兵已经将它们的发射能力解除了。斯拉克斯博士的化学工厂被摧毁了，那些化学品也被妥善处理了。
整个世界在听说美国战胜了斯拉克斯博士后都松了一口气。确信全球解放军不会再对世界制造严重威胁了，总统命令作战人员返回美国，回国的军队有如英雄般受到了数以千计的欢呼。